若系统里面的专票已经作废，但在此之后确实找不到发票原件，那么此种情况会有诸多影响： 首先是税务上的影响，专票作废后，付款方就可以在账簿上把他算做货物成本，从而减少税收，如果原件没有，那么当税务局要求后，付款方就拿不出证据，此时付款方就可能面临追税的窘境； 其次是扣分的风险，由于专票的作废是有影响发票得分的，如果原件没有了，那么就可能无法证明实际发生发票的情况，从而导致发票得分受到影响。 最后也是最重要的，就是法律上的影响，若付款方确实没有发票原件，那么在有第三方索赔的情况下，双方就可能因为此而发生长期纠纷，最终导致在法律上受到不利影响。 综上所述，专票作废后，即使发票原件没有，有可能对扣分、税务以及法律都会对双方产生一定的影响。 拓展知识：发票分分类，有增值税专用发票、增值税普通发票、普通发票、卷式发票、电子发票等。发票分类根据发票抬头是发票的用途，和发票的属性不同，可以报销的也不同。