风险提示企业开具发票收入大于所得税申报收入处理需要按照《中华人民共和国所得税法》第三十四条及其实施条例第四十五条以及其相关实施规定，结合实际情况，对企业开具发票收入大于所得税申报收入的情况进行处理，包括核实发票原始记载情况、查明发票真实有效性情况、检查发票使用情况、核实发票税款使用情况、核实收款人账户情况等多个环节进行核实等。 企业在申报所得税时，一定要准确根据发票实际收入申报征收，以免有违反所得税法的情形，因此收税机关会对这类情况加以严格管理，严查发票收入大于所得税申报收入的情况。 拓展：企业可以采取多种方式来提高发票真实有效性，比如，可以采用防伪技术处理发票，以便于发票真伪的鉴定；可以对发票数据进行上报，以便在税务机关进行发票税收管理；可以采用电子发票管理，以便于发票的查询与检索；可以采取电子签名等方式来处理发票。