根据法院判决，支付对方公司赔偿金的情况下，是需要向对方索取发票入账的。因为国家对赔偿金的开支支出有严格的规定和管理，基于财务合规考量，实际履行支付赔偿金的行为，只有凭借正式发票才能够被支付。发票也可以作为有效的凭证，证明履行过公司应尽义务，以及担保该款项的真实性。另外，有的公司可能会因为计提费用原因，需要对赔偿金开具发票。 考虑到上述这些因素，支付对方公司赔偿金时，有必要向对方索取发票入账。根据《企业会计准则》第47条规定，当企业支付赔偿金时，应加强发票的审核工作，要求发票内容准确有效，发票须经审核之后才能入账发放。 总之，对于支付对方公司赔偿金这种情况，索取并开具有效发票可以完成所有费用相关的财务审计和会计报告，避免出现财务审计出现问题。同时发票也是证明支付过赔偿金的有效证据，索取发票是必要的。