甲公司为增值税一般纳税人，适用的增值税率为13%。 根据发生的经济业务活动，甲公司可以按如下计算： (1) 接受乙公司投入市价为40万元的A设备一台，确认乙公司实收资本35万元，采用年限平均法折旧，因此甲公司每年折算的原值为3.5万元，残值3.5*10%=0.35万元，折旧额即原值减去残值 3.5-0.35=3.15万元。 (2) 将自产的商品作为福利发放给本公司管理人员，该产品成本8万，市场售价10万，甲公司以10万减去8万的采购价格，增值2万元，根据增值税一般纳税人征收税率为13%，甲公司应该缴纳的增值税为：2万×13%=260元。 (3) 将A设备对外出售，发生清理费用2万元，取得价款32万，净利润差额为32万-2万=30万元，甲公司应缴纳增值税为30万×13%=3.9万元。 (4) 销售原材料一批，增值税专用发票注明售价80万元，款项已收存银行，该批材料实际成本59万元，已提存货跌价准备8万元。甲公司实际售出商品的成本为59万元，增值额为80万-59万=21万元，应纳税增值税为21万×13%=2.73万元。 (5) 公允价值上升3万元，由于期末公允价值上升，未产生增值税税额。 (6) 计提一次到期还本付息的长期借款本月利息12万元，长期借款利息支出不参与增值税纳税范畴，因此不缴纳增值税。 总结来说，甲公司计算期内应缴纳的增值税共计2.73+3.90+260=6.99万元。拓展知识：增值税一般纳税人，除增值税外其他应税项目均不缴纳，如营业税、消费税等。