是可以一部分员工做专项附加扣除一部分只做专项扣除申报的。详细来说，根据《个人所得税专项附加扣除暂行办法》，允许纳税人适用专项附加扣除项目以及部分仅适用专项扣除项目。人事部门要提供确切的税前扣除明细，让财务部能够正确的缴纳个税，可以根据员工的实际扣除情况来安排个人所得税，把员工有资格享受的税收优惠完美使用。 拓展知识：无论是个人所得税专项附加扣除还是仅适用专项扣除，企业都要注意根据相关的税收政策进行有效的税务申报，精准的扣除纳税人应当缴纳的个人所得税，准确的实现税收优惠政策。企业要制定完善的税收优惠政策，为员工创造更多的福利待遇，从而提高员工满意度，从而提升企业社会形象。