这种情况应该是由于员工没有按照公司的相关规定正确地处理发票所导致的。首先，你需要询问该员工的购买发票是否与具体的支出有关，如果是，则可以认为该发票可以作为税收减免的税务凭证，以证明该用途所购买物品是用于公司经营活动。如果不是，则可以按照有关税务法律法规规定，采取补办发票、补开发票、恢复发票、改开发票等方式。 此外，在处理发票方面，公司还需要详细审核发票，检查发票的真实性和合法性，如果有问题及时处理，避免税收风险的发生。同时，公司还应建立严格的发票审核制度，让雇员在申请报销前先填写发票申请表，以防止发票被恶意报销，以减少公司的财务成本。