根据《关于小规模纳税人专用发票税收优惠政策的通知》，小规模纳税人可以享受一定程度的专用发票税收优惠政策。而您的公司22.6月虽然开具了1%的专票，但是申报的时候，该优惠政策已经取消，只能按3%申报缴纳税款，此时只能按照实际交税金额记录在账本中，中间2个点差额可以归入本月非正常收入中，并在本月结账时抵缴，但是实际上本月还需要缴纳2个点差额的税金。 此外，在开具专用发票时，应当认真审核是否符合税收优惠政策，以避免出现以上类似情况。同时，企业有权对发票信息的真实性进行全面核查，避免发票使用于不当用途。