如果个体户和一般纳税人企业都开了账户，收到100万入账，税务局来查询时会按照纳税信息和税务报表进行比对，判断属于哪一种纳税主体，是个体户还是一般纳税企业。一般情况下，税务局会认定该100万入账属于法人所属公司的业务，因为在中国，公司才有权力发起资金大额收入，而个体户没有这类权限。同时，税务局也会集中查看法人的个人账号，看看收入的去向以及入账的次数比例，以此来判断哪种纳税主体的公司更有可能收到这笔款项。 拓展知识：财产所有权一直是负担税收的主体，但如果发生财产权转移时，有时会存在税务管理上的歧义，那么此时就需要税务机关来进行判断。比如股权转让时，转让双方必须在税务登记上标明账户属于哪一方，以便财政部门对各方税收责任进行审核和结算。因此，公司的资金流动情况和财务记录的完整性及严格性，是税务部门审核纳税主体转让关系的重要依据。