是的，a公司可以开票给b公司，因为张三作为a公司的独资有限公司的所有者，同时也是b公司的股东，他可以将a公司的财务资金作为股权投资而向b公司开具发票。比如，a公司可以支付服务费或者购买b公司的产品，这样a公司就可以向b公司开具发票。但是有两点需要注意：首先，b公司必须确保a公司的付款是明码标价，另外，a公司的付款必须符合财务分析的原则。 拓展知识： 张三作为a公司的独资有限公司的所有者，而b公司作为张三的股东，两者之间的财务关系应该是公开透明的，同时还应该实现追溯性，以免受到外部的干预和误解。