当研发费用汇算清缴的时候加计扣除后，如果研发费用没有加计扣除，则单位的财务报表中的利润会发生变化。由于研发费用是公司在研发新产品或提高产品质量，提高营业收入的必要费用，当研发费用重新被加计扣除后，这些费用将不再被认定为减除项，而是被认定为营业费用，利润率将会受到显著影响，甚至出现亏损，单位的财务报表中利润会从正数变成负数。 此外，研发费用汇算清缴的加计扣除也会对企业的税收产生影响，加计扣除后，企业的减除项目会减少，在公司计算个人所得税时，将会有较大的改变。有了加计扣除后，企业的财务状况将会发生变化，要求企业以更高的服务质量、更低的价格态度，以满足顾客的需求，减少费用，提高效益，并引入先进的科技支持，从而确保企业的可持续发展。