对于两年前开的未抵扣的专用发票，由于后面两联丢失，如果需要红冲应当遵循《企业所得税纳税服务管理办法》第四十六条第二款的规定，即应当提供当地税务机关出具的《收票证明》以及补全后红冲两联发票，由当地税务机关按照规定审核确认后，方可对该发票进行红冲；若两联发票丢失，则不属于补全红冲范围，只能作废处理，作废的发票两联应当销毁。 除此之外，企业还可以通过纳税人发票管理信息系统查询到发票信息，确认红冲前发票的真实性。另外，当购买发票时，应当加强发票的安全控制，避免发票丢失而出现纳税人红冲发票的情况。