在考虑公司股东个人转股权的税收问题，股东在公司占比5%，实际出资20万元，出让的1%股权收入10万元，应当缴纳的个人所得税，是按照持股比例、实际出资金额和所得收益数额来计算的。在确定纳税义务的同时，根据股权转让的具体情况，需要考虑利润性质、出售方式及股权出让约定条款，以便确定纳税基数。 在本个案中，股东占公司比例为5%，实际出资金额20万元，出让股权收入10万元，根据计算，应缴纳的个人所得税为：10万×20%×3%=6000元。 拓展知识：股权转让根据由财政部和国家税务总局关于决定股权转让合同需缴纳个人所得税的通知，股权转让的收益属于职业所得或个体经营收入，需缴纳20%的个人所得税。