根据《企业所得税法实施条例》的规定，小规模纳税人的季度销售额超过45万元，应该按三个税点的标准缴纳税款。首先，小规模纳税人的季度销售额超过45万元，即为一般纳税人，处于正常纳税人的范畴，只要满足一般纳税人的资质，即可适用正常纳税标准；其次，正常纳税人应按三个税点的标准缴税，税率为3%，即3个点，这就是按三个税点缴税的意思。 拓展：小规模纳税人是指收入、利润低于一定标准的企业、个体工商户，只要满足小规模纳税人的资质，则可以享受小规模纳税人的相关税收优惠政策，比如税率更低及申报减免等。此外，小规模纳税人还可以适用便捷管理办法，比如年度结转纳税，专项附加扣除等。