农村专业合作社开增值税发票时，中间的金额应填写实际收款金额，税率一般是按照当地所确定的政策，一般为3%。一定要打入销售方的开户行账号，这是依据税法规定，也是利于销售方后期核对和报税的过程。此外，开具专业合作社发票也需要符合一定的财务标准，需要保证实际收款金额与发票金额的一致性，确保发票的合规性。 此外在纳税过程中，还需要注意纳税完成时间的要求，如果超过规定的期限，可能会受到当地税务机关的处罚，因此，在开具发票的过程中，大家需要遵守税务相关的法律法规，以获得个人和经济的安全保障。