对于员工在上班期间意外去世，公司与员工家属签订的赔偿合同，可以抵扣其所得税汇算清缴金额。根据《税收征管法》第七十六条，被视为“损失”的财产买卖合同可以抵扣财产收入所得税汇算清缴金额，因此与员工家属签订的赔偿合同，能够抵扣其应纳税所得额汇算清缴税款。 要想发挥上述抵扣效果，应满足以下条件：1、公司的支出费用必须是合法合规的；2、支出费用必须是一次性支出；3、支出费用必须是对损失的赔偿；4、损失必须是有关个人所得税纳税义务的增加或者减少；5、公司的报销必须经过发票，结果计入公司的账项中。 此外，要想申请抵扣所得税汇算清缴，企业还必须提供除财务账目外的其他证明文件，以确保赔偿金额的合法性，并且企业必须配合财政和税务部门的检查。 拓展知识：此外，在企业纳税抵扣过程中，根据《企业所得税法》第十六条规定，企业可以将固定资产折旧、可变资产折旧等损失用于扣除税款，从而获得纳税抵扣的优惠。