答：个人所得税汇算清缴的工资收入是扣除了五险一金和专项附加的。五险一金指的是养老保险金、失业保险金、工伤保险金、医疗保险金和生育保险金；专项附加指的是住房公积金和社会保险费，以及商业健康保险和大病医疗保险等专项支出。个人所得税汇算清缴里面的工资收入是按照税前收入将五险一金和专项附加等扣除后得出的，所以，个人所得税汇算清缴里面的工资收入是扣除了五险一金和专项附加的。 拓展：个人所得税的计算方法是按照收入额的不同，对应不同的税率和速算扣除数，根据计算公式，计算出应交纳的个人所得税金额。在汇算清缴系统中，会将按照规定的五险一金和专项附加等进行扣除，然后根据当前月度和季度合计应纳税额计算出个人所得税金额。