您好，根据《会计处理准则》规定，小规模公司第二季度开票收入，做账会计分录应该分开做，收入应当分录记入主营业务收入，税收应当分录记入应交税费。 具体操作步骤如下：首先做收入分录，贷方科目为主营业务收入，借方科目为银行存款；接着，做税额分录，贷方科目为应交税费，借方科目为银行存款。 此外，在记账的时候，还要考虑到以下两点：一是要比较税前收入以及税后收入，判断税费是否准确；二是检查发票，确认应开发票金额和实开发票金额是否一致。 总之，小规模公司第二季度开票收入，做账会计分录的时候，要正确做收入分录和税额分录，同时检查发票，以确保最终结果的准确性。