农民工工资专用账户是由农民工所在单位按照国家有关规定，经劳动者签字确认后向开户行开立的一种专门用于发放工资的账户，目的是为了用于更好地保护农民工的劳动报酬权益。 针对农民工工资专用账户，工资支付是由农民工所在单位发放，银行开户行负责农民工工资专用账户的管理，单位应在支付当月劳动者工资时，将劳动者个人可以支配的部分款项打入其农民工工资专用账户。 同时，可能会在支付农民工工资时有扣留的情况出现，如农民工所在单位有未支付的社会保险费、公积金、个人所得税等费用时，可以根据有关法律法规扣留农民工工资，但是，单位不可任意扣留农民工工资，应当在支付前说明扣留理由，经劳动者签字确认后方可扣留，并给予相应补偿。 总而言之，农民工工资专用账户是由劳动者所在单位按照国家规定开立的一种专用账户，主要用于保护农民工劳动报酬权益，会有扣留情况出现，但扣留必须及时进行解释，并经劳动者签字确认后方可。 拓展知识：近年来，农民工工资专用账户的运用已经成为法律法规的重要内容，是每个单位必须履行的义务，依法实行农民工工资专用账户，有助于加强农民工的劳动权益，也是每个单位的法定选择。另外，为了进一步规范农民工工资支付管理，在我国各地出台了大量相关政策，例如，江苏省出台江苏省劳动保护特别行政区农民工工资专用账户及支付管理问题的规定，明确农民工工资专用账户的开立与使用，可有效保护农民工劳动报酬的支付和使用，维护农民工的权益。