一般纳税人开具的6%咨询服务发票可以在附表三中扣除，但不需要交增值税。根据《中华人民共和国企业所得税法实施条例》第三十六条的规定，在符合条件的情况下可以享受到抵扣政策，那么可以从企业所得税当期应纳税所得额中抵扣6%的咨询服务发票。此外，根据《中华人民共和国增值税暂行条例》规定，增值税免税项目之一是技术推广及技术服务收入，咨询服务属于技术服务收入，其发票免征增值税，也就是说，开具的6%咨询服务发票不用交税。 拓展知识：税收中，营改增是指，在原企业所得税的基础上，将部分税负转移到增值税上，改革企业所得税制度，实现了税收优惠与负担均衡，使税负由企业转移到商品消费领域，形成以增值税为主，企业所得税为辅的新体制。