金蝶旗舰版供应链模块中，入库单与领料单数量、金额上的一致，但领料单仍不能审核，提示库存数量不允许负数的原因是：金蝶旗舰版的供应链模块中有一项重要的设置——库存调整政策，这是指，在领料单审核前，要求先检查是否符合库存调整政策，以确保库存数量具有合理性。因此，对于审核领料单这一操作，需要首先检查库存数量是否符合库存调整政策，除此之外，还要注意及时维护库存信息，及时更新库存数量，以及开发良好的库存管理规范等，以保证供应链管理的有效性和准确性。