A公司和B公司都应该按照规定的财务核算要求进行账务处理，A公司要收取B公司的租金，并开具发票。同时B公司也要根据应付租金的情况开具发票给A公司，并在财务处理中，根据本公司属性进行归类，如营业外收入，应收账款等。在财务报表中，可以将各自的业务情况分别进行统计，以便监督管理公司的发展和财务状况。 此外，A公司和B公司要在财务上严格落实租赁合同的规定，如果一方不履行或不能履行的约定，应及时解决，以确保正常经营，避免未来的纠纷。