是的，在这种情况下，会有影响。因为根据《中华人民共和国税收法》的规定，对于施工预付款和安全文明施工费，即使它们是一起打进账户的，但是仍然需要按照相应的比例进行税收的缴纳。安全文明施工费是按照9%的税率进行计算缴纳，也就是说，这里的安全文明施工费需要缴纳9%的税费。此外，安全文明施工费在缴纳税费时，还要注意到安全文明施工费是否是针对单一订单实施的，如果是，则不需要缴纳税费。 拓展知识：安全文明施工费，是指为满足城市行政管理部门和施工单位提出的安全文明施工要求而施工单位支付的施工费用，是施工单位实施施工所需要负担的费用，其中包括出勤工资、设备租赁费，也就是安全文明施工的直接费用，需要按照一定的比例缴纳税收，主要是为了鼓励施工单位重视安全文明施工，确保施工安全。