专项附加扣除是指在缴纳个人所得税时，按照国家规定附加扣除额度，如子女教育、赡养老人等扣除一部分，以减轻纳税人税负的扣除方式。专项附加扣除可分为“自申报、自领取”和“由单位代缴代扣代退”两种形式。 如果员工使用个人所得税App自行操作申报，那么就不需要公司申报了，但是如果员工没有在个人所得税App操作申报，那么公司就需要代缴代扣代退的形式申报专项附加扣除，这种情况下，公司需要及时把个税缴纳的信息上传到国家税务局，以便员工个人纳税时享受专项附加扣除，同时公司也需要提供申报资料，包括员工的身份信息、收入情况及专项附加扣除金额等。 总之，员工自行申报的话，就不需要公司申报了，如果员工没有申报的话，就需要公司申报了，那么就需要向税务局提供相关的资料，以保证员工正确享受专项附加扣除。另外，关于专项附加扣除应用于何种收入，专项附加扣除金额如何计算，国家税务总局提供的个人所得税法律法规文件有明确规定，因此上级税务机关及其工作人员应当正确认识，并按照规定精准执行。