处理这种情况，应该从交易记录出发，首先检查甲方付款记录，结合交易记录计算出实际应付款，最后进行清账。如果账面有多出，则要求甲方支付补差价，如果有账面短缺，则可以与甲方协商将短缺金额计入下次的付款额度。此外，为了避免此类问题的重复发生，应完善企业管理体系，建立完善的记账政策和程序，促进公司业务的高效和可持续发展。 拓展知识：初步清账时，可以采用两步法，即将客户的应收账款和应付账款分别清算一致性，同时利用比照法和抵销法检查客户应收和应付账款是否记账正确。最后根据客户收支情况，完成全额清账工作。特别要重视对客户赊销，履行合同等事由的记账，以确保记账准确无误。