按照国家规定，工程合同中标和建设方签订后，由总公司派出分公司实施工程，是不违规的。不过，在实施过程中，要充分考虑以下几个方面：一是组建一个专门的管理团队，来严格监督实施情况，以及质量、进度等；二是定期组织技术研讨，对施工重点、难点等全面分析；三是实施过程中定期检查，对于工程进度、质量等控制要求；最后是统一销项发票管理，保障分公司在销项和进项方面都有良好的记录，以免出现偷漏税等情况。拓展知识：工程合同签订完成后，还要注意资金管理，及时准确地记录收入支出，实施预算管理，确保工程进行得顺利、有序，且按时完成。