开9%运输发票是不可以的，因为运输发票是仅限于有货车和有运输许可证的企业开具的，没有货车和运输许可证的，不具备开具运输发票的资格，只有具备了货车和运输许可证的情况下，才具备开具9%运输发票的资格。 来自物流行业的运费，一般分为两种：6%货运代理费及9%运输发票，其中6%货运代理费是指物流公司为货主提供拖车、订舱、配载、代缴等一系列服务关系而收取的费用，而9%运输发票则是指物流公司提供运输服务并由物流公司负责运输货物和收取货款的费用。因此，仅仅有6%货运代理费的发票，如果物流公司的货车运输货物，具备9%运输发票的条件，那么就可以开具9%运输发票了，而机动车运输货物时，只能开具6%运费代理费发票。因此，在开具运费发票前，必须先判断运输货物的运输方式，以确定正确的发票类型，以保证质款正确地给到双方支付。