小规模纳税企业的药店进货取得的增值税专票可以抵扣。根据小规模纳税人税务登记资料，支持小规模纳税企业取得增值税专票，在缴纳税款时，可以把增值税专票作为成本来扣除，并用于抵扣应交税款。在取得增值税专票的情况下，如果增值税专票上开具票据商品明细，则可以作为扣除费用；如果增值税专票上没有开具票据商品明细，仅可以作为累计额度来扣除。 除了抵扣之外，小规模纳税企业还可以使用增值税专票来参与企业所得税流通税减免政策，部分企业都可以从其中获得更多的福利政策。此外，小规模纳税企业还可以使用增值税专票来报销所包含的费用，以减轻企业的经营压力。