更正三季度所得税申报退税会有一定的影响，首先，更正三季度申报时，会影响到未来对对财务状况的评估，即使有退税也可能导致企业未来贷款、借贷等事项被拒绝，其次，过去欠税可能会造成未来的所得税稽查，甚至有可能被罚款，最后，退税的数额过大容易引起税务部门的警惕，进而引发调查。因此，在更正所得税申报时，应加以谨慎，避免引起税务部门的调查和处罚。 拓展知识：更正三季度所得税申报，除了要谨慎避免被税务部门查获，还要注意两个点，一是遵守税收优惠政策，尽可能减免企业的税收；二是根据已有收入和已缴税款情况，按照规定时间进行税收申报，按期缴纳税款。如此，可以最大化减少更正税务申报和退税可能对企业带来的破坏，才能使企业正常发展，保证其财务健康。