新入职员工第二个工资月应扣缴社保是正常的。这是因为，社保缴纳事宜是由政府按照国家法律法规规定，要求企业将员工工资中一定比例的费用用于缴纳社会保险费用，包括养老保险费、失业保险费、医疗保险费、工伤保险费等。而每个工资月的社保缴纳比例及金额相应的也会有所变动，这是因为政府定期会调整社保缴纳政策，以便维护公民的利益。因此，新入职的员工第二个工资月会扣缴更多的社保费用是正常的。 另外，企业在新入职员工第二个工资月内应按照规定计算出相应的社保缴纳金额，然后将员工工资中一定比例的费用用于缴纳社会保险费用，以确保员工的社保利益得到充分保障。此外，企业还应定期监督社保缴费政策的执行情况，及时了解新政策，以便正确优化员工的社保缴纳，使员工获得较好的社会保障合理分配。