工资薪金申报中的扣款是指按税收法律规定，个人应当扣缴的税款，包括个人所得税，住房公积金等，是由个人扣款，而不是公司扣款。个人收入分为三种情况：薪金、佣金和报酬，若其中有一部分超出年度起征点的薪金、佣金和报酬，则需要申报工资薪金所得缴纳个人所得税，只要超出起征点，就需要按照税率支付缴纳薪金税款。缴费具体税率视个人薪金所得计税月应纳税所得额而定，一般根据个人薪金所得计税月应纳税所得额的不同可分为3个级别：第一级的税率为3%，第二级的税率为10%，第三级的税率为20%。另外，根据个人薪金所得计税月应纳税所得额的不同，应纳税额也有所变化，税收优惠措施也可减免部分个人所得税。此外，个人还需要缴纳住房公积金，一般个人和公司各自等额缴纳，公司平均每月缴纳个人住房公积金的额度占个人本月应发薪金的7%-20%。