如果发票收入大于所得税，企业需要按照规定进行处理。首先，需要核实发票收入是否真实可靠，确认之后，根据相关法律法规，企业应当按照适用比例缴纳所得税，比例可以在税务机关网站上查询获得。其次，如果所得税超出发票收入，企业需要向税务机关发出申报通知，按照有关规定使用其它缴款书缴纳所得税。最后，企业需要查验税务机关的税收登记证，位于最后页，以确保所得税已经缴纳完毕。 另外，根据国家规定，企业在计算所得税时，也可以考虑应纳税所得额最高减除额，这样可以减少实际所得税支出。有了这些基本知识，企业能更好地管理所得税，控制财务风险，并用这些税收节省资金去投资促进发展。