处理已经保存够五年的定额发票存根，可以采取如下步骤： 1、根据定额发票上所种类型组织起发票处理工作； 2、建立账户标题体系，并且把发票归档； 3、把每类发票依次按意见、款项、税金等类别整理； 4、从发票存根中找出有税金的发票，核对税金，确保正确无误； 5、结合业务系统，把已经存根的发票逐一核实，最终把发票存根完全归档。 拓展知识：财务核算时应该充分考虑发票的保存期限，发票存根保存期限为 3 年，普通发票应按月归档，已开具发票存根保存期限为 5 年。发票核销期间，应按照定额发票、专用发票、普通发票等种类，分别建立系统账户体系，确保发票的准确性和准确性。