首先，软件公司在开票内容上应该按照《征收管理条例》及相关税收部门的要求进行开票。在此基础上，软件公司可以在发票上写明“云端服务器存储服务费”或“软件公司提供的云端服务器存储服务费”等具体服务内容。 另外，在具体开票前，软件公司也需要确定发票上将要填写的具体内容，如货物名称，规格型号，单位等信息，以及服务费用的合计金额，这些内容可以在购买服务之前，与服务提供方商定好，以免发票上出现纰漏。 此外，软件公司还需要加强财务管理，比如，定期收取客户的报帐列表，以及定期进行报帐核查，以便确保发票的真实性，确保税收的准确性。