外贸企业付代理海运费的分录如下：一、借方科目：应付运费；贷方科目：银行存款。二、借方科目：应收运费；贷方科目：银行存款。这里代表企业代理客户海运费，客户承担运费，企业只是代收代交，所以需要两个分录，一个是企业要向客户转账，另一个是企业要从客户收款。这样，企业的货币资金流向有清晰的记录。 此外，外贸企业在进行海运费的交易时，应该严格遵守贸易法律规定，收取合理的海运费，并严格遵守运输协议。外贸企业应加强与客户之间的信息交流，以确保客户熟悉运输过程中的全部规定，让客户明白货物运输及相关事宜，以减少潜在的纠纷，并确保货物的安全运输。