发票勾选平台里只抵扣一部分税额，根据《增值税改革税收征管暂行条例》，可分两步进行勾选： 首先，在发票验收页面，登录税务网站，根据发票信息填写所有需要填写的内容，包括发票金额、税率、税额等，准确填写后点击提交。 其次，进入发票勾选平台，根据发票提交的信息确认，确认后勾选“仅抵扣部分税额”，勾选完毕后点击提交。 如果勾选时出现任何问题，可以重新登录税务网站，核对填写信息是否正确，或者联系当地税务管理机关进行核实。 拓展知识：目前，发票勾选平台实现了增值税销项税收征管改革，增值税纳税人可以直接在网上完成发票的验收、勾选和抵扣的手续，这是一项重要的税收改革措施，有利于提高税收征管的质量和效率。