是的，个体工商户的应纳税所得额应该按照40%的比例扣除，根据《中华人民共和国企业所得所得税法》第四十六条规定，所得税的企业所得税法应按照20%至35%的税率计算，另外，个体工商户还必须加上政府规定的印花税，增值税，城市维护建设税等，另外，个体工商户可以减免一定的所得税，具体的减免税率以及减免标准，可以登录政府网站或者咨询税务专家获得答案。拓展知识：在实际工作中，除了在个体工商户中缴纳税款外，还应该承担相应的社会保险费用，另外，立法机构还应该推出相应的政策，以减轻个体工商户的税收负担。