处理增值税申报表的偏差大致有以下几种方式： 一，财务据实重新做账：根据增值税申报表上的凭证，由财务人员重新对凭证进行审核，并在财务核算系统中重新做账，这样财务核算系统中的金额就能和申报表上的信息一致了。 二，弥补差额：一般来说，如果在增值税申报中多交了税，则需要把多交的税金补回到企业，但是有的时候税务机关可能不同意，此时可以根据税务机关的要求提供证明材料，申请弥补差额。 三，申请冲销：如果税务机关不同意弥补差额，也可以申请冲销，即申请把已交的税金冲销，再重新申报一次增值税纳税，但是要注意的是，申请冲销需要提前准备足够的证明材料，以及税务机关的认可。 除此之外，在进行增值税申报表的处理时，还应该注意以下几点： 1.保留好增值税申报表上的所有凭证和发票，定期核实发票是否与申报表上的信息一致，以确保申报的准确性。 2.要及时更新已抵扣的发票，以确保发票的真实性，并严格把控申报工作流程。 3.要及时查看财务管理系统中的数据，以确保数据的准确性，并及时更新。 4.要及时了解当前税收政策以及税务机关的公告，以确保申报工作的准确性。 拓展知识： 在日常的增值税申报表工作中，还应该使用税收信息化系统，可以实现数据上传、代开发票等功能，提高税务管理的效率和水平。