税务局查企业成本费用大于发票金额是当企业在报税时发现其实际的成本和费用超过发票金额，就会根据《中华人民共和国企业所得税法》和《中华人民共和国企业所得税管理条例》，在办理税务手续时被税务机关进行查处。一般情况下，当实际成本和费用超过发票金额，企业就会多缴税款。税务机关会根据《中华人民共和国企业所得税法》和《中华人民共和国企业所得税管理条例》的规定，计算企业多缴的税款，并向企业收取相应的补税款。同时，为了惩处企业的违法行为，税务机关还可以根据《企业所得税法》规定的处罚规则，对企业进行行政处罚，包括收缴违法所得、罚款等。 拓展知识： 税务局查企业成本费用大于发票金额，企业除了要补缴税款，还须认真核查财务账目，彻底剔除“偷税漏税”行为，加强财务审计，密切监控税收缴纳情况，以避免企业被税务机关查处的风险。此外，企业还应当重视税务局的信息报送工作，准确报送发票信息、进出口信息等，以及建立税收/成本关系，并定期进行抽查核查的工作，以期税务申报和征税规则的完整及时遵守。