长期使用对公户转账给法人或者某个员工，风险主要在于资金流向和安全性。由于对公账户是用来支出公司正常经营活动的，转账给法人或者某个员工，如果不能有效进行管理，很易导致财务走私，账户被盗，甚至非法转账，由于违规转账带来的风险。因此，为了避免上述风险，公司应当建立严格的办理程序，记录转账记录，建立完善的转账政策，定期对账，严格管理转账业务，实现资金的有效流动。另外，公司应当对对公户的安全性进行有效的控制，尤其是个人信息的保护，在账户系统中配置多重安全策略，以防账户被盗。此外，公司可以利用银行控台系统，配置专属限额，尽量避免账户资金被大额转账，以及引入安全管理软件，进行实时的安全监控，保障转账的安全性。