在合并两个公司的账套时，首先需要对这两个公司的账户信息进行详细的统计和审核，要了解它们的每一项账务。其次，可以根据客户款项的情况来把两个账套合并到一个账套中去，并将原有的账户信息进行整合，确定新账套中的账目信息是完整的。最后，在新账套中建立初始数据，它包括各种类型的财务凭证，如订单、收据、发票等，用于记录每一笔业务的具体信息，并录入到账套中，便于财务管理和会计统计。 此外，从软件角度，可以考虑采用ERP（Enterprise Resource Planning）企业资源规划系统。ERP 系统集成企业功能模块，可以更好的处理企业信息系统、供应链管理、客户关系管理、销售管理和会计等，有助于提高企业管理水平和效率。