企业提供运输服务时应开具运输业增值税专用发票，包含运费、增值税以及包装费等三项。 甲公司支付的100万运费、增值税9万，以及包装费1万，实际企业收到的金额为110万，其中增值税9万部分并不属于企业自己，而是必须上缴的政府税款，这部分税金是被计入企业实际收到的金额的。由于增值税是增值税纳税人在出售商品、提供劳务、实行国家补贴等活动中对销售额（或收入）产生的税费，所以必须计入企业实际收到的金额，以便政府按期收税，保证国家财政收入正常运转。 此外，拓展知识，运输服务类增值税应税率为3%，具体以发票上的税率为准。在计算增值税金额时，不仅要计算运输费，还要将包装费、保险费等纳入到计算范围内，以便精准计算增值税金额。