作废发票的处理方法主要有两种： 1.缴存法：即作废发票实体本身保存存放，由专人复核单份，并交报税务机关备案。 2.销毁法：即采用国家规定的方法将发票销毁，销毁不完全或发生变故的，须重新销毁。 一般来讲，在省级以上税务机关认可的发票打印厂及开具点条件下，可采用缴存法进行更证书作废发票的处理；而对于一般税务机关不认可的开具点，应选用销毁法来处理作废发票。 当然，最佳的做法是最大限度地避免发票的作废，一是要提高发票开具的质量，二是要采取合理的发票册控制机制，防止出现发票作废的情况。 拓展知识：近期，税务总局印发了《税收征管信息化发票管理办法》（试行），该法规定，通过发票管理平台处理作废发票时，可以不需要实体发票，只需要登记发票的票面信息，并上传至税务机关电子监管平台中即可完成发票的作废处理，省去了实体发票的销毁和缴存程序，大大提高了效率。