如果公司双方对于电子合同版本没有异议，那么是可以使用电子版本的合同的。根据《中华人民共和国合同法》和相关法律法规，电子合同可以具有法律效力，也受到合同法和其他法律的保护。然而，电子合同的制作及其效力的认可存在着一定的实质性困难，包括：一是缺乏可靠的可识别信息；二是确认合同双方的身份困难；三是证明电子合同双方的真实意思并通过技术手段来确认合同条款的执行。为此，在使用电子合同时，应当尽可能做好充分准备，以保证电子合同内容及其有效性。另外，不同行业也可以根据实际情况，结合我国不同行业法律法规，确定电子合同的合法性和有效性，以确保合同的有效性。拓展知识：电子合同的有效性从根本上来说，与以往我们以纸质合同为主的时代应当做出不同的考量，主要包括：一是数字化的互联网技术；二是在数字化技术中参与合同签订及其履行的交互机制；三是对参与合同的关系方身份的识别，例如支付宝等。