根据《企业所得税法》规定，如果员工报销超过公司规定的限额，所产生的进项税额只能抵扣部分，而不能全额抵扣，一般按报销金额与实际发票金额之比确定进项税额抵扣金额，即报销金额500/发票金额1000=50%,进项税额只能抵扣50%。 拓展知识：企业要把企业报销的税收发票实务抵扣，还需要满足一定标准，比如：一定不能超过公司报销单限额；报销发票和报销单金额要一致或是，报销单金额不能小于发票金额；同一业务范围内，发票可以分段报销，但是报销发票后，不能再次报销，也就是说不能重复报销；最后，不符合公司财务规章制度的会计凭证不可以作为报销凭证。