在独立核算的同城门店之间调拨库存商品，可以采用往来处理的方式，即出货门店借：应收账款，贷：库存商品，以后就用应付冲应收的方式进行清算，此种方式可减少往来双方的记账成本和税务烦恼。 但是，商品调拨是不能免税的，对于库存商品的调拨货物，如果不开具增值税发票，将会存在涉税风险。如果出入库双方发生纠纷，可能会存在税务证明缺失问题，会面临税务审计风险。 为了减少涉税风险，建议调拨双方在进行商品调拨时，要开具正规的增值税发票，保持良好的涉税记录，正确的填写纳税声明，认真履行税务登记、申报、缴纳义务，遵守相关税收法规。