个体工商户和有限责任公司（自然人独资）在纳税方面有很大的区别。 1、个体工商户是指以个人名义从事经营活动的经营者，其主要特点是无法进行法人法律行为，经营收入受个人所得税法的约束，受纳税义务的是个人本人。而有限责任公司（自然人独资）是法人单位，受营业税、增值税、企业所得税等法律的约束，受纳税义务的是公司本身，而不是自然人独资者。 2、个体工商户企业所得税税率高达25%，同时个体工商户不能享受企业非正常损益减免税，而有限责任公司（自然人独资）的企业所得税税率可降至20%-25%，同时有限责任公司可以享受企业非正常损益减免税。 3、个体工商户的帐户安全程度相比有限责任公司要低，而有限责任公司的账户安全程度高于个体工商户，有限责任公司可以通过采取有效的措施防止交易风险。 在纳税方面，个体工商户和有限责任公司（自然人独资）有着明显的区别，企业在选择经营形式时，应该考虑到税务方面的问题，合理选择自身经营形式可以更好地减少税务负担，并有利于企业的发展。 拓展知识：如果有限责任公司的本金超过500万，那么其付给股东的股息也必须征收20%的企业所得税。