个体工商户季报应由纳税人自行报送，而自然人电子税务局有一员工的纳税人，根据税收管理法第八十二条规定，除特殊情况外，每年应报送一次季报，并在报送期限内报送，报送季报不受报送次数限制。自然人电子税务局只有一个员工的纳税人，按照国家规定，应当每季报送一次个体工商户季报，按规定时间报送。拓展知识：根据《税收征管法》，纳税人应当按照国家有关规定向税务机关报送有关财务报表、纳税申报表等文件，纳税人应当及时有效履行税收申报义务，不得有违反规定的行为。