小规模纳税人在上报增值税汇总信息时，如果开票系统没有上报汇总，可以采取以下措施： 首先，根据税收法规自行审核汇总信息，并使用税收征管信息系统填报，并填写普通发票的数据与抵扣发票的数据，及增值税专用发票信息自行填报； 其次，确保开票系统的上报汇总信息准确无误，并及时取得运营账号的报告，以便与财政部门核对； 最后，小规模纳税人可以采用税收征管信息系统进行数据报送，这样可以有效避免上述汇总信息不准确，影响税务管理工作。 此外，小规模纳税人应重视税务管理工作，务必以财税和财务管理的道德准则为基础，加强专业知识的提升，做到税收准守相关法律法规，配合财税机构完成税务管理工作。