在自行建造厂房的情况下，外购的原材料的增值税应当由发票抵扣，而不是原来进项税额转出的方式，因为自行建造厂房并不符合《企业所得税税收优惠政策执行细则》中“住宅、厂房、设备以及其它设施的改建、改造，以及在投资转固范围内的原材料购置”的规定，所以无法用进项税额转出的方式进行税收优惠。另外，在自行建造厂房的情况下，原材料也无法满足转固任务所需的累计投资金额，因此也不能使用进项税额转出的方式进行领用。因此，在自行建造厂房的情况下，外购的原材料应当以发票抵扣的方式，缴纳增值税。 拓展知识：抵扣发票是指企业在购买原材料或者其他货物、服务时，以发票作为证据，申请向税务机关减免应纳税款的税收优惠政策。抵扣发票的申请要求企业提交的资料比较多，但优惠程度也会更高。