首先，根据《中华人民共和国农民工保护法》规定，建筑工程单位应当将农民工工资归集到农民工专户，而不是归集到基本账户中。农民工专户里的钱，一般情况下是只能以发放工资的方式发放出去的，不能以分包开劳务发票，付劳务费当时出去。但是，也有例外情况，当农民工专户里存放的钱超过允许的任务完成金额时，在项目经理和劳务建设单位的协商同意的情况下，可以进行分包开劳务发票，付劳务费当时出去。 总而言之，农民工专户里的钱一般是以发放工资的方式发放出去，但是除此之外，也可以在特定条件下，采用分包开劳务发票，付劳务费当时出去的方式。另外，为了便于建筑工程企业定位合法的农民工工资，可以采用更严格的农民工工资发放管理制度，严格按照法律规定用农民工专户收取、归集和发放农民工工资。